学校部门决算反映西南交通大学本级、西南交通大学峨眉校区的经费收支情况。
学校2015年收入总计287869.09万元，与2014年相比，增加15050.53万元，增长5.52%。其中：财政拨款收入增加18079.45万元，事业收入减少7,170.87万元，经营收入减少1,119.06万元，其他收入增加5,261.01万元。2015年教育部加大了对学校财政拨款；事业收入由于2013年年底上缴财政专户的事业收入在2014年返还，造成了两年收入对比差异较大。
学校2015年支出总计271650.30万元，与2014年相比，增加40217.69万元，增长17.38%。其中：一般公共服务支出增加9.4万元，教育支出增加37195.36万元，科学技术支出增加1122.98万元，节能环保支出增加500元，住房保障支出增加1389.95万元。
学校2015收入总计287869.09万元，财政拨款收入134220.25万元，占总收入的46.63%；事业收入115496.40万元，占总收入的40.12%；经营收入8706.22万元，占总收入的3.02%；其他收入29446.22万元，占总收入的10.23%。
学校2015年各项支出总计271650.3万元，其中基本支出191781.73万元，占总支出的70.60%；项目支出71951.34万元，占总支出的26.49%；经营支出7917.22万元，占总支出的2.91%。
按照支出功能科目划分，一般公共服务支出78万元，占总支出的0.03%；教育支出258549.08万元，占总支出的95.18%；科学技术支出2913.8万元，占总支出的1.07%；节能环保支出增加500元，占总支出的0.18%；住房保障支出9609.02万元，占总支出的3.54%。
学校2015年财政拨款支出总计为135397.47万元，其中基本支出95539.9万元，占总支出的70.56%；项目支出39857.57万元，占总支出的29.44%。具体包括：
1.高等教育（2050205），2015年决算数为123323.32万元，比2014年决算数增加15.59%。
2.来华留学教育（2050602），2015年决算数为1590万元，比2014年决算数增长18.92%。
3.教师进修支出（2050801），2015年决算数为10.8万元。
4.其他教育支出（2059999），2015年决算数为56.46万元。
5.机构运行（2060201），2015年决算数为500万元。
6.重点实验室及相关设施（2060204），2015年决算数为2226.17万元。